Výskum, v ktorom vedci použili nový prístup k bioinformatickej analýze, tiež rozšíril katalóg známych mikrobiálnych génov z 3 na 10 miliónov.
Výsledky tohto výskumu, publikovaného v nedeľu v časopise Nature Biotechnology, sú súčasťou európskeho projektu MetaHIT (Metagenomics Human Intestinal Tract), ktorý má 11, 4 milióna EUR na skúmanie toho, ako sa ľudský mikrobiom týka zdravia a chorôb., Vall d'Hebron Institut de Recerca (VHIR) je jedným z 13 účastníkov tohto projektu - a jediným španielskym centrom - pod vedením Dr. Francisca Guarnera, ktorý vysvetlil, že nie všetky študované vzorky ho majú. počet neznámych druhov.
Vzorky črevnej flóry niektorých jedincov majú veľmi málo z týchto druhov a pri podrobnej analýze videli, že ide o vzorky pacientov s Crohnovou chorobou. „To naznačuje, že tieto druhy, doteraz neznáme, sú pravdepodobne také, ktoré robia rozdiel medzi mikrobiotami zdravých ľudí a chorobami chorých, “ oznámil Guarner.
"Dobré baktérie"
Podľa výskumníka tieto údaje otvárajú stratégie zamerané na obnovu týchto druhov pomocou nutričných zásahov: podávanie vlákien, prebiotík, ktoré pomáhajú selektívnemu rastu niektorých druhov alebo probiotík.
Tieto neznáme baktérie sú pravdepodobne takzvanými „dobrými baktériami“, pretože nie sú typickými baktériami, ktoré spôsobujú infekciu, ani nie sú známe alebo izolované skôr. Podľa Guarnera sa zistené baktérie nedajú izolovať, pretože „takmer určite neprežijú mimo hrubého čreva, aby boli transplantované“.
Osoba poverená prácou a výskumníkom skupiny VHIR pre fyziológiu a trávenie patofyziológie uviedla, že objavené nové druhy „nie sú kultivovateľné, sú veľmi citlivé na kyslík, to znamená, že sú veľmi prísnymi anaeróbmi a vytvárajú veľkú závislosť od svojho prostredia, aby boli schopné prežiť. “ „Z toho istého dôvodu, keď sme šli do databáz, nenašli sme stopu a doteraz sme o nich nevedeli nič, “ povedal Guarner.
Rôzne metagenomické druhy
Tento objav bol možný vďaka novému prístupu k bioinformatickej analýze, ktorý týmto druhom umožnil „vynoriť sa“.
„V súčasnosti - podľa Guarnera - je známych iba 10% zo sekvenovaného genetického materiálu s 95% spoľahlivosťou. Zostáva tak veľká šedá oblasť, na ktorej sa práve pracuje.“
Štúdia odhalila 741 rôznych metagenomických druhov pomenovaných podľa nemožnosti ich priradenia názvu. Na rozdiel od databáz vedci zistili, že 115 týchto druhov už bolo známych, zatiaľ čo 518 neznámych; zvyšných 108 je čiastočne známych.
„Teraz vieme, ako vyzerá genóm týchto metagenomických druhov, ale nie ich mená a priezviská, “ vysvetlil Guarner.
Existuje malý počet druhov, ktorých druh nie je známy, ale ich pohlavie alebo rodina, ku ktorej patria, a približne 200 metagenomických druhov opísaných druhov nemožno žiadnym spôsobom klasifikovať, pretože viac ako 80% ich génov je úplne neznámych dnes.
Osoba má 600 000 mikrobiálnych génov
Podľa vedcov sú mikroorganizmy, ktoré žijú u ľudí, asi 100 miliárd, čo je 10-krát viac, ako je celkový počet ľudských buniek.
Počiatočné výsledky toho istého projektu v roku 2010 poukázali na 3 300 000 rôznych génov, ktoré sa preložili na 20 000 rôznych funkcií, z ktorých 5 000 bolo doteraz úplne neznámych.
Každá osoba má asi 600 000 týchto mikrobiálnych génov a 300 000 sa neustále opakuje medzi všetkými jedincami. „V tejto novej štúdii sa tento počet vynásobí tromi a dosiahne sa 9 879 896 rôznych génov, “ uviedol Guarner.
Zdroj: www.DiarioSalud.net
