Transdukcia sekvencií v DNA je málo známym javom a považuje sa za zriedkavý. Jej hlavnou postavou je 50% genómu nazývaného parazitická DNA, tvoreného prvkami, ktoré sa občas replikujú a migrujú na iné miesta v genetickej sekvencii.
„Zistili sme, že špecifický typ sekvenčnej transdukcie súvisiacej s oblasťou genómu s názvom LINE-1 je pomerne častý, najmä v genómoch rakoviny pľúc a hrubého čreva, “ hovorí José Tubío, výskumný pracovník inštitútu Wellcome Trust Sanger Institute of Cambridge a prvý signatár článku, ktorý je publikovaný v časopise Science.
Spolu s ním a ako súčasť veľkej medzinárodnej skupiny vedcov sa na práci podieľali štyria ďalší španielski vedci: Marta Tojo, Íñigo Martincorena, Jorge Zamora a Pablo Román.
Umiestnenie najaktívnejších prvkov
Vedci analyzovali mobilitu prvkov LINE-1 v 300 genómoch 12 rôznych typov rakoviny a zistili, že iba 74 z 500 000 transponovateľných prvkov typu LINE-1 prítomných v ľudskej DNA sa dokáže pohybovať v rakovinových genómoch.,Na dosiahnutie tohto záveru vedci vyvinuli algoritmus, ktorý identifikuje a lokalizuje pôvod a nové umiestnenia mobilných prvkov LINE-1.
„Vedieť, ktoré transponovateľné prvky nášho genómu majú aktivitu v nádoroch a kde sa skrývajú, otvára dvere dizajnu liekov, ktoré umlčujú mutagénnu aktivitu týchto 74 prvkov v rakovine, bez potreby použitia širokospektrálnych liekov, ktoré môžu ovplyvniť ostatných. regióny genómu, “hovorí Román, jeden zo spoluautorov práce a v súčasnosti vedecký pracovník HUCA v oblasti kostného a minerálneho metabolizmu.
Mobilizácia kompletných génov
Ako vedci poznamenali, sekvenčná transdukcia vyplývajúca z aktivity prvkov LINE-1 niekedy zahŕňa mobilizáciu kompletných génov a ich prenos do iných oblastí DNA. Preto sa mení štruktúra, počet génov a genómová expresia.Na druhej strane „sme zistili, že s migráciou transponovateľných prvkov boli spojené epigenetické zmeny. Vzhľadom na to, že epigenetické zmeny úzko súvisia so životným prostredím, táto práca poukazuje na nový spôsob vzťahu medzi genómom a tým, ako jeme a dýchame.“, hovorí Roman.
Podľa slov Tubia, „bude potrebné vykonať viac štúdií, aby sme zodpovedali otázky položené týmto výskumom o funkčných dôsledkoch mechanizmu, ktorý sme pozorovali, ale niet pochýb o tom, že toto zistenie poskytuje novú perspektívu záujmu o diagnostiku a liečbu. onkologický lekár. ““
Zdroj: www.DiarioSalud.net
